Erzwingen des Benutzens der Referenzierung der Projekte im Workspace (Eclipse Helios) funktioniert folgendermaßen (Danke Mauro).
Soll ein Projekt mit Namen access und mit gleichem Artefaktnamen angezogen und über WTP eingespielt werden, so muss man per Hand die Einträge in der entsprechenden Settings-Datei abändern.
.settings/org.eclipse.wst.common.component
<dependent-module deploy-path="/WEB-INF/lib" handle="module:/resource/access/access">
<dependency-type>uses</dependency-type>
</dependent-module></code>
Sonst wird eine JAR-Version aus dem (lokalen) Repository gezogen und eingespielt, welche nicht mit der aktuellen Artefakt-Version nach POM des geöffneten Projekts im Workspace übereinstimmt.