Es ist von großem Vorteil, wenn klar wird, dass die m2eclipse-Entwickler die WTP-Integration nicht als ihre Hauptaufgabe betrachten. Deswegen ist die Unterstützung des WTP-Deploy-Prozesses bei der Maven-Integration im Eclipse auch oft brüchig.

Aber es gibt eine Abhilfe, welche sich in optionalen Paketen unter einer eigenen Update-URL verbirgt:

http://m2eclipse.sonatype.org/sites/m2e-extras

Wenn man die dortige WTP-Unterstützung ausgewählt und installiert hat, dann entfallen meistens die manuellen Anpassungen der org.eclipse.wst.common.component, um die richtigen Artefakte, respektive Workspace-Abhängigkeiten einzutragen.